La Faculté des sciences de l’éducation a été fondée en 2002, pour répondre à des impératifs nationaux :

par la professionnalisation des métiers de l’enseignement et de l’encadrement scolaires. Elle y contribue à travers la mise en place du Certificat d’aptitude pour l’enseignement secondaire (CAPES), et des Masters professionnels en « Gestion scolaire », et en « Coordination disciplinaire et conseil pédagogique ». Ces diplômes visant la formation des enseignants des cycles complémentaire et secondaire, ainsi que celle des chefs d’établissements scolaires, des directeurs de cycles et des coordinateurs de matières.

Elle y contribue par la mise en place d’un cursus de Master recherche et de Doctorat.

par le développement de la pédagogie universitaire. Ceci est rendu possible grâce aux activités du Laboratoire de pédagogie universitaire, et de l’Unité des nouvelles technologies éducatives, ainsi que par l'instauration d'un diplôme en pédagogie universitaire.

Les méthodes actives qu’elle privilégie dans ses enseignements, voudraient outiller les personnes qui s’y forment de « savoir devenir ».

La Faculté entend donc, fidèle à la mission de service public assumée par l’Université Saint Joseph, participer par ces biais, à la nécessaire évolution du système éducatif libanais.
Elle s’inscrit dans une longue tradition d’enseignement et de recherche pédagogique à l’Université. Sa fondation a permis de fédérer ces formations dans un projet cohérent, visible, et susceptible de les doter d’une finalité commune.

En 2005 s’y constitue le Laboratoire de pédagogie universitaire. Ce Laboratoire est un cadre de réflexion autour de diverses problématiques pédagogiques, un cadre d’harmonisation des représentations et des pratiques, un cadre de mutualisation et de diffusion des pratiques innovantes et un cadre de soutien pour les enseignants universitaires. Plateforme fédératrice, le Laboratoire regroupe des représentants de toutes les institutions de l’USJ.

Cette même année s’y fonde l’Unité des nouvelles technologies éducatives, qui est le lieu privilégié pour l’expérimentation, la mise en œuvre et la mutualisation des pratiques et méthodes des nouvelles technologies. Elle a pour mission de répondre aux besoins des institutions et de leurs enseignants pour concevoir, créer et mettre en œuvre modules et supports de formation et d’évaluation en ligne.

En 2005 également, s’y rattache l’Institut libanais d’éducateurs.

La Faculté est ouverte au monde, elle est affiliée à des associations internationales, et reçoit annuellement un certain nombre d’intervenants étrangers ou de stagiaires. Elle est également ouverte à toute la richesse de la réalité libanaise, de  par la constitution de son public, provenant de toutes les régions du Liban, de toutes les confessions et de divers types d’écoles. Elle peut donc jouer un rôle moteur dans l’évolution du système éducatif libanais, et devenir un lieu où se forge une culture éducative commune, vitale pour le développement du pays.

En Septembre 2007, s'y fonde le Département de formation continue (DFC).

Les formations assurées par le Département de formation continue s’adressent aux chefs d’établissements scolaires, directeurs de cycles, surveillants, responsables, coordinateurs disciplinaires, conseillers pédagogiques, enseignants des cycles complémentaire et secondaire de toutes les disciplines et anciens de la FSédu :
- Formations « sur mesure » : suite à la demande d’un établissement scolaire, le département conçoit et met en place des formations.
- Formation proposées par la FSédu : le département propose un programme annuel de formation. Les formations du DFC ne sont pas diplômantes.
Ce département assure, à la demande, un suivi pour les sessions mises en place.